18 tim ini dibagi ke dalam tiga grup. Kedua kompetisi kelompok umur itu akan berkompetisi di Bandung. Tiga venue telah disiapkan. Untuk U-16 di Stadion Arcamanik, Stadion Lodaya, dan Stadion Progresif.
Sementara itu, U-18 akan bermain di Stadion Si Jalak Harupat, Stadion Gelora Bandung Lautan Api, dan Stadion Sabilulungan.
Berikut ini pembagian grup untuk gelaran MOLA Elite Pro Academy 2021:
GRUP A
Madura United FC
PSM Makassar
Persiraja Banda Aceh
Arema FC
Persik Kediri
Borneo FC
GRUP B
Bali United FC
PSS Sleman
PS Tira
Persipura Jayapura
PS Barito Putera
Persija Jakarta
GRUP C
Persela Lamongan
PSIS Semarang
Persita Tangerang
Bhayangkara FC
Persebaya Surabaya
Persib Bandung
