PCR SGTF adalah sekuensing genom sampel positif menggunakan kit RT-PCR yang menggunakan strategi 'S' Gene Target Failure (SGTF) untuk mendeteksi varian.

Mengutip New Indian Express, Jumat (7/1/2021), peneliti bidang diagnosis COVID-19 di India, Krishna Khairnar mengatakan tes ini menarget beragam gen dari virus sehingga akan ada banyak varian yang bisa diungkap.

Dalam kasus varian Omicron, gen 'S' tidak terdeteksi dalam uji RT-PCR Thermofisher karena mutasi pada gen, sedangkan target gen lain seperti gen ORF dan gen N terdeteksi.

"Kejadiannya disebut sebagai kasus positif 'S' Gene Target Failure (SGTF).

Sampel tersebut dapat diduga dilaporkan sebagai Omicron positif," jelas Khairnar.

Lebih lanjut Khairnar menginformasikan bahwa strategi SGTF berfokus pada pengambilan sampel positif yang hasil uji RT-PCR menunjukkan hasil gen 'S' negatif, tetapi gen ORF dan N positif.

Strategi SGTF akan berfungsi sebagai semacam deteksi dini pada tahap RT-PCR.

Dengan begitu, Khairnar yakin ini akan membantu dalam penyaringan sampel positif COVID-19 varian Omicron.

Kendati demikian, baik RT-PCR yang diikuti oleh sekuensing genom akan membantu deteksi dini kasus Omicron, menurutnya. (brs/berbagai sumber)

Editor: Yayu Fathilal