Setelah meninggalkan Liverpool, dia memimpin Lyon meraih dua gelar Prancis sebelum bergabung dengan Federasi Sepak Bola Prancis pada 2007, tetapi dia dibujuk kembali ke manajemen oleh Villa pada September 2010, menandatangani kontrak tiga tahun.

Tetapi pada bulan April berikutnya Houllier dirawat di rumah sakit karena nyeri dada dan Gary McAllister turun tangan untuk membantu menjauhkan Villa dari masalah degradasi.

Dia mengundurkan diri dari peran tersebut pada akhir musim 2010-11 dengan kekhawatiran bahwa kembali ke ruang istirahat dapat menyebabkan masalah kesehatan lebih lanjut.

Sejak saat itu ia memegang peran kepala sepak bola di Red Bull, dan pada November menjadi direktur teknis klub sepak bola wanita Lyon dan OL Reign. (edj)